Protein–RNA interactions for Protein: O76090

BEST1, Bestrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST1O76090 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BEST1O76090 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BEST1O76090 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BEST1O76090 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BEST1O76090 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
BEST1O76090 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BEST1O76090 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BEST1O76090 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BEST1O76090 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BEST1O76090 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BEST1O76090 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BEST1O76090 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BEST1O76090 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BEST1O76090 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BEST1O76090 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BEST1O76090 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BEST1O76090 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BEST1O76090 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BEST1O76090 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BEST1O76090 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BEST1O76090 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BEST1O76090 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BEST1O76090 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BEST1O76090 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BEST1O76090 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BEST1O76090 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
BEST1O76090 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BEST1O76090 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BEST1O76090 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BEST1O76090 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BEST1O76090 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BEST1O76090 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BEST1O76090 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BEST1O76090 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BEST1O76090 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BEST1O76090 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BEST1O76090 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BEST1O76090 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BEST1O76090 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BEST1O76090 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BEST1O76090 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BEST1O76090 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BEST1O76090 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
BEST1O76090 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BEST1O76090 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BEST1O76090 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
BEST1O76090 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BEST1O76090 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
BEST1O76090 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BEST1O76090 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BEST1O76090 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BEST1O76090 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BEST1O76090 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BEST1O76090 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
BEST1O76090 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BEST1O76090 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BEST1O76090 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BEST1O76090 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BEST1O76090 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BEST1O76090 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BEST1O76090 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BEST1O76090 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BEST1O76090 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BEST1O76090 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BEST1O76090 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BEST1O76090 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BEST1O76090 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BEST1O76090 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BEST1O76090 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BEST1O76090 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
BEST1O76090 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BEST1O76090 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BEST1O76090 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BEST1O76090 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BEST1O76090 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
BEST1O76090 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
BEST1O76090 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
BEST1O76090 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
BEST1O76090 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
BEST1O76090 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
BEST1O76090 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BEST1O76090 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BEST1O76090 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BEST1O76090 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BEST1O76090 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BEST1O76090 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BEST1O76090 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BEST1O76090 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BEST1O76090 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BEST1O76090 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BEST1O76090 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BEST1O76090 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BEST1O76090 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BEST1O76090 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BEST1O76090 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BEST1O76090 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BEST1O76090 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BEST1O76090 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BEST1O76090 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BEST1O76090 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms