Protein–RNA interactions for Protein: O75935

DCTN3, Dynactin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN3O75935 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DCTN3O75935 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DCTN3O75935 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DCTN3O75935 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DCTN3O75935 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DCTN3O75935 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DCTN3O75935 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DCTN3O75935 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DCTN3O75935 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DCTN3O75935 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DCTN3O75935 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
DCTN3O75935 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DCTN3O75935 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DCTN3O75935 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DCTN3O75935 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DCTN3O75935 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DCTN3O75935 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DCTN3O75935 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DCTN3O75935 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DCTN3O75935 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DCTN3O75935 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DCTN3O75935 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DCTN3O75935 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DCTN3O75935 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DCTN3O75935 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
DCTN3O75935 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DCTN3O75935 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DCTN3O75935 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DCTN3O75935 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DCTN3O75935 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DCTN3O75935 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DCTN3O75935 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DCTN3O75935 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DCTN3O75935 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DCTN3O75935 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DCTN3O75935 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DCTN3O75935 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DCTN3O75935 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DCTN3O75935 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DCTN3O75935 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DCTN3O75935 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DCTN3O75935 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DCTN3O75935 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DCTN3O75935 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DCTN3O75935 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DCTN3O75935 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DCTN3O75935 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DCTN3O75935 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DCTN3O75935 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DCTN3O75935 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DCTN3O75935 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DCTN3O75935 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DCTN3O75935 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DCTN3O75935 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DCTN3O75935 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DCTN3O75935 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DCTN3O75935 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DCTN3O75935 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
DCTN3O75935 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DCTN3O75935 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DCTN3O75935 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
DCTN3O75935 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DCTN3O75935 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DCTN3O75935 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DCTN3O75935 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DCTN3O75935 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DCTN3O75935 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DCTN3O75935 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DCTN3O75935 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DCTN3O75935 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DCTN3O75935 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DCTN3O75935 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
DCTN3O75935 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DCTN3O75935 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DCTN3O75935 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DCTN3O75935 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DCTN3O75935 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DCTN3O75935 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
DCTN3O75935 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DCTN3O75935 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DCTN3O75935 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DCTN3O75935 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DCTN3O75935 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DCTN3O75935 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DCTN3O75935 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DCTN3O75935 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DCTN3O75935 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DCTN3O75935 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DCTN3O75935 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DCTN3O75935 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DCTN3O75935 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DCTN3O75935 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DCTN3O75935 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DCTN3O75935 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DCTN3O75935 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DCTN3O75935 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DCTN3O75935 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
DCTN3O75935 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
DCTN3O75935 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
DCTN3O75935 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms