Protein–RNA interactions for Protein: O75909

CCNK, Cyclin-K, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNKO75909 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCNKO75909 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CCNKO75909 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCNKO75909 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCNKO75909 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCNKO75909 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCNKO75909 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCNKO75909 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCNKO75909 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCNKO75909 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCNKO75909 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCNKO75909 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCNKO75909 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCNKO75909 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCNKO75909 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCNKO75909 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCNKO75909 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCNKO75909 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCNKO75909 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCNKO75909 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCNKO75909 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCNKO75909 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCNKO75909 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCNKO75909 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCNKO75909 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCNKO75909 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCNKO75909 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCNKO75909 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCNKO75909 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCNKO75909 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCNKO75909 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCNKO75909 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCNKO75909 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCNKO75909 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCNKO75909 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCNKO75909 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCNKO75909 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CCNKO75909 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCNKO75909 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCNKO75909 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCNKO75909 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCNKO75909 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCNKO75909 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCNKO75909 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCNKO75909 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CCNKO75909 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCNKO75909 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCNKO75909 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCNKO75909 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCNKO75909 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCNKO75909 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCNKO75909 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCNKO75909 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCNKO75909 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCNKO75909 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CCNKO75909 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCNKO75909 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCNKO75909 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCNKO75909 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCNKO75909 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CCNKO75909 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCNKO75909 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCNKO75909 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCNKO75909 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCNKO75909 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCNKO75909 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCNKO75909 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCNKO75909 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCNKO75909 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCNKO75909 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCNKO75909 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCNKO75909 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCNKO75909 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCNKO75909 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCNKO75909 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCNKO75909 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCNKO75909 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCNKO75909 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CCNKO75909 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCNKO75909 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCNKO75909 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCNKO75909 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCNKO75909 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCNKO75909 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCNKO75909 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCNKO75909 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCNKO75909 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCNKO75909 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCNKO75909 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCNKO75909 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCNKO75909 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCNKO75909 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCNKO75909 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCNKO75909 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCNKO75909 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCNKO75909 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCNKO75909 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CCNKO75909 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCNKO75909 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCNKO75909 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms