Protein–RNA interactions for Protein: O75808

CAPN15, Calpain-15, humanhuman

Predictions only

Length 1,086 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN15O75808 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CAPN15O75808 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CAPN15O75808 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CAPN15O75808 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CAPN15O75808 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CAPN15O75808 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CAPN15O75808 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CAPN15O75808 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CAPN15O75808 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
CAPN15O75808 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CAPN15O75808 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CAPN15O75808 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CAPN15O75808 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CAPN15O75808 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CAPN15O75808 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CAPN15O75808 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CAPN15O75808 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CAPN15O75808 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CAPN15O75808 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CAPN15O75808 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CAPN15O75808 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CAPN15O75808 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CAPN15O75808 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CAPN15O75808 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CAPN15O75808 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CAPN15O75808 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CAPN15O75808 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CAPN15O75808 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CAPN15O75808 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CAPN15O75808 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CAPN15O75808 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CAPN15O75808 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CAPN15O75808 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CAPN15O75808 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CAPN15O75808 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CAPN15O75808 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CAPN15O75808 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CAPN15O75808 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CAPN15O75808 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
CAPN15O75808 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CAPN15O75808 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CAPN15O75808 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CAPN15O75808 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CAPN15O75808 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CAPN15O75808 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CAPN15O75808 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CAPN15O75808 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CAPN15O75808 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CAPN15O75808 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CAPN15O75808 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CAPN15O75808 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CAPN15O75808 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CAPN15O75808 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CAPN15O75808 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CAPN15O75808 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CAPN15O75808 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CAPN15O75808 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CAPN15O75808 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CAPN15O75808 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CAPN15O75808 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CAPN15O75808 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CAPN15O75808 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CAPN15O75808 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CAPN15O75808 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CAPN15O75808 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CAPN15O75808 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CAPN15O75808 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CAPN15O75808 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CAPN15O75808 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CAPN15O75808 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CAPN15O75808 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CAPN15O75808 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CAPN15O75808 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CAPN15O75808 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CAPN15O75808 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CAPN15O75808 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CAPN15O75808 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CAPN15O75808 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CAPN15O75808 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CAPN15O75808 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CAPN15O75808 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CAPN15O75808 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CAPN15O75808 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CAPN15O75808 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CAPN15O75808 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CAPN15O75808 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CAPN15O75808 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CAPN15O75808 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CAPN15O75808 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CAPN15O75808 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CAPN15O75808 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CAPN15O75808 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CAPN15O75808 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CAPN15O75808 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CAPN15O75808 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CAPN15O75808 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CAPN15O75808 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CAPN15O75808 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CAPN15O75808 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CAPN15O75808 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms