Protein–RNA interactions for Protein: O75648

TRMU, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMUO75648 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRMUO75648 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRMUO75648 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRMUO75648 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRMUO75648 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRMUO75648 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRMUO75648 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRMUO75648 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TRMUO75648 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRMUO75648 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRMUO75648 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRMUO75648 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRMUO75648 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TRMUO75648 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRMUO75648 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRMUO75648 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRMUO75648 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRMUO75648 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRMUO75648 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRMUO75648 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRMUO75648 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRMUO75648 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRMUO75648 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRMUO75648 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TRMUO75648 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRMUO75648 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRMUO75648 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRMUO75648 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRMUO75648 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRMUO75648 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRMUO75648 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRMUO75648 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRMUO75648 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRMUO75648 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRMUO75648 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRMUO75648 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRMUO75648 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRMUO75648 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRMUO75648 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRMUO75648 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRMUO75648 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TRMUO75648 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRMUO75648 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRMUO75648 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRMUO75648 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRMUO75648 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRMUO75648 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRMUO75648 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRMUO75648 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRMUO75648 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRMUO75648 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRMUO75648 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRMUO75648 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRMUO75648 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRMUO75648 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRMUO75648 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRMUO75648 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRMUO75648 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRMUO75648 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRMUO75648 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRMUO75648 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRMUO75648 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRMUO75648 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRMUO75648 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRMUO75648 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRMUO75648 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRMUO75648 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRMUO75648 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRMUO75648 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRMUO75648 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRMUO75648 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRMUO75648 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRMUO75648 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRMUO75648 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRMUO75648 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRMUO75648 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRMUO75648 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRMUO75648 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRMUO75648 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRMUO75648 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRMUO75648 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRMUO75648 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TRMUO75648 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRMUO75648 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRMUO75648 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRMUO75648 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRMUO75648 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRMUO75648 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRMUO75648 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRMUO75648 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRMUO75648 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRMUO75648 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRMUO75648 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRMUO75648 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRMUO75648 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRMUO75648 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRMUO75648 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRMUO75648 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRMUO75648 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRMUO75648 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms