Protein–RNA interactions for Protein: O75604

USP2, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP2O75604 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP2O75604 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP2O75604 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP2O75604 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP2O75604 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP2O75604 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP2O75604 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP2O75604 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP2O75604 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP2O75604 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP2O75604 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP2O75604 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP2O75604 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
USP2O75604 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP2O75604 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP2O75604 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP2O75604 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP2O75604 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
USP2O75604 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP2O75604 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP2O75604 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP2O75604 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP2O75604 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
USP2O75604 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
USP2O75604 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
USP2O75604 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
USP2O75604 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP2O75604 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP2O75604 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
USP2O75604 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP2O75604 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP2O75604 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
USP2O75604 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
USP2O75604 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
USP2O75604 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
USP2O75604 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
USP2O75604 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
USP2O75604 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
USP2O75604 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP2O75604 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP2O75604 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
USP2O75604 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
USP2O75604 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
USP2O75604 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
USP2O75604 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
USP2O75604 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
USP2O75604 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
USP2O75604 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
USP2O75604 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
USP2O75604 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
USP2O75604 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
USP2O75604 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
USP2O75604 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
USP2O75604 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
USP2O75604 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
USP2O75604 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
USP2O75604 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
USP2O75604 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
USP2O75604 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
USP2O75604 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
USP2O75604 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
USP2O75604 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
USP2O75604 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
USP2O75604 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
USP2O75604 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
USP2O75604 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
USP2O75604 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
USP2O75604 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
USP2O75604 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP2O75604 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
USP2O75604 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP2O75604 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP2O75604 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP2O75604 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP2O75604 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
USP2O75604 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
USP2O75604 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
USP2O75604 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
USP2O75604 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
USP2O75604 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
USP2O75604 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
USP2O75604 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
USP2O75604 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
USP2O75604 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
USP2O75604 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
USP2O75604 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
USP2O75604 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
USP2O75604 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
USP2O75604 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
USP2O75604 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
USP2O75604 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
USP2O75604 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
USP2O75604 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP2O75604 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP2O75604 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
USP2O75604 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP2O75604 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP2O75604 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP2O75604 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP2O75604 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms