Protein–RNA interactions for Protein: O75578

ITGA10, Integrin alpha-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA10O75578 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGA10O75578 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGA10O75578 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGA10O75578 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGA10O75578 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGA10O75578 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGA10O75578 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ITGA10O75578 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ITGA10O75578 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ITGA10O75578 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ITGA10O75578 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ITGA10O75578 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ITGA10O75578 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGA10O75578 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGA10O75578 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGA10O75578 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGA10O75578 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGA10O75578 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGA10O75578 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGA10O75578 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGA10O75578 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGA10O75578 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGA10O75578 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGA10O75578 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGA10O75578 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGA10O75578 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGA10O75578 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGA10O75578 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGA10O75578 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGA10O75578 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGA10O75578 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGA10O75578 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGA10O75578 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGA10O75578 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGA10O75578 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGA10O75578 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGA10O75578 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGA10O75578 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGA10O75578 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGA10O75578 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGA10O75578 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGA10O75578 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGA10O75578 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGA10O75578 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGA10O75578 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGA10O75578 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGA10O75578 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGA10O75578 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGA10O75578 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGA10O75578 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGA10O75578 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ITGA10O75578 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGA10O75578 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGA10O75578 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGA10O75578 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGA10O75578 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGA10O75578 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGA10O75578 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGA10O75578 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGA10O75578 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGA10O75578 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGA10O75578 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGA10O75578 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGA10O75578 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGA10O75578 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGA10O75578 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGA10O75578 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGA10O75578 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGA10O75578 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGA10O75578 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGA10O75578 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGA10O75578 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGA10O75578 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGA10O75578 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGA10O75578 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGA10O75578 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGA10O75578 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGA10O75578 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGA10O75578 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGA10O75578 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGA10O75578 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGA10O75578 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGA10O75578 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGA10O75578 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGA10O75578 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGA10O75578 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGA10O75578 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGA10O75578 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGA10O75578 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGA10O75578 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGA10O75578 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGA10O75578 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGA10O75578 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGA10O75578 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGA10O75578 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGA10O75578 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGA10O75578 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGA10O75578 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGA10O75578 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGA10O75578 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.8 ms