Protein–RNA interactions for Protein: O75364

PITX3, Pituitary homeobox 3, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3O75364 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PITX3O75364 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PITX3O75364 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PITX3O75364 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PITX3O75364 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PITX3O75364 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PITX3O75364 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PITX3O75364 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PITX3O75364 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PITX3O75364 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PITX3O75364 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PITX3O75364 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PITX3O75364 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PITX3O75364 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PITX3O75364 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PITX3O75364 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
PITX3O75364 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PITX3O75364 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PITX3O75364 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PITX3O75364 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PITX3O75364 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PITX3O75364 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PITX3O75364 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
PITX3O75364 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PITX3O75364 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PITX3O75364 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PITX3O75364 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PITX3O75364 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PITX3O75364 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PITX3O75364 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PITX3O75364 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PITX3O75364 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PITX3O75364 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PITX3O75364 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PITX3O75364 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PITX3O75364 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PITX3O75364 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PITX3O75364 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PITX3O75364 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PITX3O75364 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PITX3O75364 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PITX3O75364 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PITX3O75364 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PITX3O75364 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PITX3O75364 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PITX3O75364 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PITX3O75364 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PITX3O75364 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PITX3O75364 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PITX3O75364 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PITX3O75364 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PITX3O75364 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PITX3O75364 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PITX3O75364 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PITX3O75364 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PITX3O75364 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PITX3O75364 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PITX3O75364 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PITX3O75364 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PITX3O75364 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PITX3O75364 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PITX3O75364 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PITX3O75364 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PITX3O75364 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PITX3O75364 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PITX3O75364 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PITX3O75364 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PITX3O75364 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PITX3O75364 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PITX3O75364 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PITX3O75364 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PITX3O75364 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PITX3O75364 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PITX3O75364 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PITX3O75364 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PITX3O75364 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PITX3O75364 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PITX3O75364 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PITX3O75364 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PITX3O75364 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PITX3O75364 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PITX3O75364 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
PITX3O75364 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PITX3O75364 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
PITX3O75364 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PITX3O75364 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PITX3O75364 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PITX3O75364 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PITX3O75364 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PITX3O75364 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PITX3O75364 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PITX3O75364 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PITX3O75364 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PITX3O75364 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PITX3O75364 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PITX3O75364 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PITX3O75364 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PITX3O75364 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PITX3O75364 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PITX3O75364 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms