Protein–RNA interactions for Protein: O60671

RAD1, Cell cycle checkpoint protein RAD1, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD1O60671 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAD1O60671 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAD1O60671 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAD1O60671 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAD1O60671 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAD1O60671 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RAD1O60671 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAD1O60671 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAD1O60671 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAD1O60671 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAD1O60671 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAD1O60671 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAD1O60671 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RAD1O60671 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RAD1O60671 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAD1O60671 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAD1O60671 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAD1O60671 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAD1O60671 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAD1O60671 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAD1O60671 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAD1O60671 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAD1O60671 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAD1O60671 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAD1O60671 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAD1O60671 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAD1O60671 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAD1O60671 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAD1O60671 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAD1O60671 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAD1O60671 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAD1O60671 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAD1O60671 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAD1O60671 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAD1O60671 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAD1O60671 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAD1O60671 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAD1O60671 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAD1O60671 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAD1O60671 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAD1O60671 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAD1O60671 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAD1O60671 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAD1O60671 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD1O60671 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD1O60671 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD1O60671 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD1O60671 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD1O60671 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD1O60671 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD1O60671 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAD1O60671 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RAD1O60671 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAD1O60671 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAD1O60671 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAD1O60671 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RAD1O60671 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RAD1O60671 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RAD1O60671 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RAD1O60671 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RAD1O60671 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RAD1O60671 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAD1O60671 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAD1O60671 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAD1O60671 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAD1O60671 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAD1O60671 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAD1O60671 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAD1O60671 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAD1O60671 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAD1O60671 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RAD1O60671 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RAD1O60671 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAD1O60671 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAD1O60671 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAD1O60671 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAD1O60671 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAD1O60671 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAD1O60671 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAD1O60671 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAD1O60671 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAD1O60671 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAD1O60671 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAD1O60671 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAD1O60671 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAD1O60671 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAD1O60671 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAD1O60671 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAD1O60671 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RAD1O60671 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAD1O60671 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RAD1O60671 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAD1O60671 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAD1O60671 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAD1O60671 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RAD1O60671 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RAD1O60671 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAD1O60671 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAD1O60671 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAD1O60671 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms