Protein–RNA interactions for Protein: O60383

GDF9, Growth/differentiation factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF9O60383 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GDF9O60383 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GDF9O60383 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GDF9O60383 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GDF9O60383 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GDF9O60383 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GDF9O60383 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GDF9O60383 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GDF9O60383 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GDF9O60383 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GDF9O60383 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GDF9O60383 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GDF9O60383 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GDF9O60383 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GDF9O60383 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GDF9O60383 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GDF9O60383 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GDF9O60383 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GDF9O60383 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GDF9O60383 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GDF9O60383 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GDF9O60383 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GDF9O60383 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GDF9O60383 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GDF9O60383 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GDF9O60383 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GDF9O60383 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GDF9O60383 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GDF9O60383 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GDF9O60383 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GDF9O60383 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GDF9O60383 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
GDF9O60383 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GDF9O60383 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GDF9O60383 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GDF9O60383 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GDF9O60383 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GDF9O60383 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GDF9O60383 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GDF9O60383 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GDF9O60383 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GDF9O60383 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GDF9O60383 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GDF9O60383 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
GDF9O60383 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GDF9O60383 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GDF9O60383 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GDF9O60383 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GDF9O60383 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GDF9O60383 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GDF9O60383 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GDF9O60383 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GDF9O60383 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
GDF9O60383 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
GDF9O60383 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GDF9O60383 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GDF9O60383 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GDF9O60383 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
GDF9O60383 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GDF9O60383 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GDF9O60383 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GDF9O60383 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GDF9O60383 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GDF9O60383 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GDF9O60383 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GDF9O60383 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GDF9O60383 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
GDF9O60383 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GDF9O60383 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
GDF9O60383 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GDF9O60383 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GDF9O60383 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GDF9O60383 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GDF9O60383 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GDF9O60383 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GDF9O60383 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GDF9O60383 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GDF9O60383 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GDF9O60383 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GDF9O60383 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GDF9O60383 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GDF9O60383 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GDF9O60383 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GDF9O60383 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GDF9O60383 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
GDF9O60383 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GDF9O60383 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GDF9O60383 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
GDF9O60383 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24■■□□□ 1.43
GDF9O60383 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
GDF9O60383 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24■■□□□ 1.43
GDF9O60383 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24■■□□□ 1.43
GDF9O60383 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
GDF9O60383 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GDF9O60383 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GDF9O60383 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GDF9O60383 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GDF9O60383 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GDF9O60383 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GDF9O60383 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms