Protein–RNA interactions for Protein: O43795

MYO1B, Unconventional myosin-Ib, humanhuman

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO1BO43795 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
MYO1BO43795 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
MYO1BO43795 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
MYO1BO43795 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC29.46■■■□□ 2.31
MYO1BO43795 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
MYO1BO43795 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
MYO1BO43795 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
MYO1BO43795 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
MYO1BO43795 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
MYO1BO43795 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
MYO1BO43795 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
MYO1BO43795 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
MYO1BO43795 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
MYO1BO43795 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
MYO1BO43795 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
MYO1BO43795 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
MYO1BO43795 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
MYO1BO43795 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
MYO1BO43795 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
MYO1BO43795 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
MYO1BO43795 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
MYO1BO43795 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
MYO1BO43795 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
MYO1BO43795 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC29.42■■■□□ 2.3
MYO1BO43795 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
MYO1BO43795 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
MYO1BO43795 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
MYO1BO43795 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
MYO1BO43795 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
MYO1BO43795 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
MYO1BO43795 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
MYO1BO43795 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
MYO1BO43795 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
MYO1BO43795 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
MYO1BO43795 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
MYO1BO43795 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
MYO1BO43795 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
MYO1BO43795 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
MYO1BO43795 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
MYO1BO43795 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
MYO1BO43795 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
MYO1BO43795 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
MYO1BO43795 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
MYO1BO43795 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
MYO1BO43795 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
MYO1BO43795 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
MYO1BO43795 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
MYO1BO43795 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
MYO1BO43795 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
MYO1BO43795 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
MYO1BO43795 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
MYO1BO43795 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
MYO1BO43795 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
MYO1BO43795 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
MYO1BO43795 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
MYO1BO43795 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
MYO1BO43795 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
MYO1BO43795 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
MYO1BO43795 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
MYO1BO43795 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
MYO1BO43795 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
MYO1BO43795 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
MYO1BO43795 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
MYO1BO43795 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
MYO1BO43795 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
MYO1BO43795 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
MYO1BO43795 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
MYO1BO43795 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
MYO1BO43795 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
MYO1BO43795 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
MYO1BO43795 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
MYO1BO43795 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
MYO1BO43795 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
MYO1BO43795 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
MYO1BO43795 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
MYO1BO43795 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
MYO1BO43795 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
MYO1BO43795 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
MYO1BO43795 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
MYO1BO43795 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
MYO1BO43795 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
MYO1BO43795 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
MYO1BO43795 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
MYO1BO43795 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
MYO1BO43795 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
MYO1BO43795 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
MYO1BO43795 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
MYO1BO43795 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
MYO1BO43795 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
MYO1BO43795 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
MYO1BO43795 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
MYO1BO43795 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
MYO1BO43795 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
MYO1BO43795 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
MYO1BO43795 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
MYO1BO43795 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
MYO1BO43795 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
MYO1BO43795 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
MYO1BO43795 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
MYO1BO43795 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms