Protein–RNA interactions for Protein: O43716

GATC, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit C, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATCO43716 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
GATCO43716 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
GATCO43716 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GATCO43716 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GATCO43716 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GATCO43716 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
GATCO43716 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GATCO43716 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GATCO43716 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GATCO43716 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GATCO43716 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GATCO43716 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GATCO43716 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GATCO43716 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GATCO43716 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GATCO43716 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GATCO43716 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GATCO43716 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GATCO43716 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GATCO43716 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GATCO43716 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GATCO43716 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GATCO43716 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GATCO43716 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GATCO43716 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GATCO43716 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GATCO43716 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GATCO43716 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GATCO43716 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GATCO43716 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GATCO43716 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GATCO43716 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GATCO43716 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GATCO43716 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
GATCO43716 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GATCO43716 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GATCO43716 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GATCO43716 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
GATCO43716 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GATCO43716 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GATCO43716 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GATCO43716 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GATCO43716 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GATCO43716 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GATCO43716 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GATCO43716 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GATCO43716 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GATCO43716 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GATCO43716 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GATCO43716 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GATCO43716 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GATCO43716 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GATCO43716 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GATCO43716 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GATCO43716 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GATCO43716 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GATCO43716 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GATCO43716 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GATCO43716 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GATCO43716 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GATCO43716 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GATCO43716 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GATCO43716 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GATCO43716 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GATCO43716 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GATCO43716 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GATCO43716 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GATCO43716 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GATCO43716 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GATCO43716 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GATCO43716 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GATCO43716 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GATCO43716 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GATCO43716 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GATCO43716 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GATCO43716 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GATCO43716 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GATCO43716 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GATCO43716 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GATCO43716 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GATCO43716 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GATCO43716 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GATCO43716 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GATCO43716 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GATCO43716 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GATCO43716 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GATCO43716 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GATCO43716 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GATCO43716 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GATCO43716 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GATCO43716 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GATCO43716 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GATCO43716 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GATCO43716 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GATCO43716 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GATCO43716 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GATCO43716 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GATCO43716 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GATCO43716 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GATCO43716 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms