Protein–RNA interactions for Protein: O43615

TIMM44, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM44O43615 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TIMM44O43615 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TIMM44O43615 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TIMM44O43615 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TIMM44O43615 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TIMM44O43615 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TIMM44O43615 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TIMM44O43615 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TIMM44O43615 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TIMM44O43615 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TIMM44O43615 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TIMM44O43615 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TIMM44O43615 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TIMM44O43615 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TIMM44O43615 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TIMM44O43615 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TIMM44O43615 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TIMM44O43615 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TIMM44O43615 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TIMM44O43615 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TIMM44O43615 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TIMM44O43615 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TIMM44O43615 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TIMM44O43615 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TIMM44O43615 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TIMM44O43615 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TIMM44O43615 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TIMM44O43615 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TIMM44O43615 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TIMM44O43615 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TIMM44O43615 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TIMM44O43615 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TIMM44O43615 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TIMM44O43615 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TIMM44O43615 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TIMM44O43615 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TIMM44O43615 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TIMM44O43615 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
TIMM44O43615 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TIMM44O43615 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TIMM44O43615 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TIMM44O43615 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TIMM44O43615 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TIMM44O43615 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TIMM44O43615 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TIMM44O43615 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TIMM44O43615 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TIMM44O43615 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TIMM44O43615 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TIMM44O43615 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TIMM44O43615 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TIMM44O43615 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TIMM44O43615 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TIMM44O43615 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TIMM44O43615 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TIMM44O43615 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TIMM44O43615 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TIMM44O43615 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TIMM44O43615 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TIMM44O43615 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TIMM44O43615 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TIMM44O43615 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TIMM44O43615 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TIMM44O43615 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TIMM44O43615 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TIMM44O43615 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TIMM44O43615 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TIMM44O43615 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TIMM44O43615 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TIMM44O43615 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TIMM44O43615 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TIMM44O43615 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TIMM44O43615 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TIMM44O43615 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TIMM44O43615 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TIMM44O43615 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TIMM44O43615 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TIMM44O43615 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TIMM44O43615 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TIMM44O43615 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TIMM44O43615 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TIMM44O43615 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TIMM44O43615 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TIMM44O43615 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TIMM44O43615 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TIMM44O43615 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TIMM44O43615 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TIMM44O43615 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TIMM44O43615 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TIMM44O43615 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TIMM44O43615 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TIMM44O43615 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TIMM44O43615 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TIMM44O43615 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TIMM44O43615 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TIMM44O43615 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TIMM44O43615 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TIMM44O43615 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TIMM44O43615 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TIMM44O43615 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms