Protein–RNA interactions for Protein: O43557

TNFSF14, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 14, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF14O43557 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNFSF14O43557 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNFSF14O43557 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TNFSF14O43557 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TNFSF14O43557 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNFSF14O43557 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNFSF14O43557 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNFSF14O43557 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNFSF14O43557 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNFSF14O43557 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TNFSF14O43557 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNFSF14O43557 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNFSF14O43557 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNFSF14O43557 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TNFSF14O43557 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNFSF14O43557 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TNFSF14O43557 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNFSF14O43557 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNFSF14O43557 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNFSF14O43557 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNFSF14O43557 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNFSF14O43557 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNFSF14O43557 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNFSF14O43557 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNFSF14O43557 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TNFSF14O43557 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNFSF14O43557 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TNFSF14O43557 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
TNFSF14O43557 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TNFSF14O43557 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TNFSF14O43557 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TNFSF14O43557 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TNFSF14O43557 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNFSF14O43557 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNFSF14O43557 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNFSF14O43557 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNFSF14O43557 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNFSF14O43557 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNFSF14O43557 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNFSF14O43557 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNFSF14O43557 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNFSF14O43557 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNFSF14O43557 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNFSF14O43557 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNFSF14O43557 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNFSF14O43557 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNFSF14O43557 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNFSF14O43557 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNFSF14O43557 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNFSF14O43557 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNFSF14O43557 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNFSF14O43557 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNFSF14O43557 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNFSF14O43557 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNFSF14O43557 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNFSF14O43557 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNFSF14O43557 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNFSF14O43557 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TNFSF14O43557 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNFSF14O43557 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TNFSF14O43557 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNFSF14O43557 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNFSF14O43557 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNFSF14O43557 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNFSF14O43557 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNFSF14O43557 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TNFSF14O43557 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNFSF14O43557 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNFSF14O43557 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNFSF14O43557 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNFSF14O43557 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNFSF14O43557 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNFSF14O43557 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNFSF14O43557 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNFSF14O43557 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNFSF14O43557 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNFSF14O43557 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNFSF14O43557 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNFSF14O43557 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNFSF14O43557 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNFSF14O43557 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNFSF14O43557 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNFSF14O43557 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNFSF14O43557 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNFSF14O43557 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNFSF14O43557 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNFSF14O43557 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNFSF14O43557 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNFSF14O43557 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TNFSF14O43557 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNFSF14O43557 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNFSF14O43557 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNFSF14O43557 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNFSF14O43557 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNFSF14O43557 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNFSF14O43557 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TNFSF14O43557 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNFSF14O43557 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNFSF14O43557 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNFSF14O43557 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms