Protein–RNA interactions for Protein: O43508

TNFSF12, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 12, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF12O43508 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNFSF12O43508 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNFSF12O43508 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNFSF12O43508 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFSF12O43508 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFSF12O43508 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFSF12O43508 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFSF12O43508 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFSF12O43508 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNFSF12O43508 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNFSF12O43508 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNFSF12O43508 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNFSF12O43508 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNFSF12O43508 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNFSF12O43508 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNFSF12O43508 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNFSF12O43508 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNFSF12O43508 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNFSF12O43508 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNFSF12O43508 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNFSF12O43508 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TNFSF12O43508 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TNFSF12O43508 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TNFSF12O43508 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TNFSF12O43508 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNFSF12O43508 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNFSF12O43508 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNFSF12O43508 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNFSF12O43508 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNFSF12O43508 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNFSF12O43508 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TNFSF12O43508 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TNFSF12O43508 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TNFSF12O43508 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TNFSF12O43508 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TNFSF12O43508 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TNFSF12O43508 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TNFSF12O43508 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TNFSF12O43508 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TNFSF12O43508 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TNFSF12O43508 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TNFSF12O43508 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TNFSF12O43508 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TNFSF12O43508 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TNFSF12O43508 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TNFSF12O43508 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TNFSF12O43508 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TNFSF12O43508 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TNFSF12O43508 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TNFSF12O43508 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TNFSF12O43508 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TNFSF12O43508 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TNFSF12O43508 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TNFSF12O43508 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TNFSF12O43508 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TNFSF12O43508 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TNFSF12O43508 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TNFSF12O43508 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TNFSF12O43508 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TNFSF12O43508 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TNFSF12O43508 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TNFSF12O43508 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TNFSF12O43508 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TNFSF12O43508 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TNFSF12O43508 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TNFSF12O43508 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TNFSF12O43508 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TNFSF12O43508 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TNFSF12O43508 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TNFSF12O43508 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TNFSF12O43508 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TNFSF12O43508 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TNFSF12O43508 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TNFSF12O43508 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TNFSF12O43508 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TNFSF12O43508 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TNFSF12O43508 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TNFSF12O43508 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TNFSF12O43508 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TNFSF12O43508 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TNFSF12O43508 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TNFSF12O43508 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TNFSF12O43508 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TNFSF12O43508 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TNFSF12O43508 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TNFSF12O43508 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TNFSF12O43508 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TNFSF12O43508 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TNFSF12O43508 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TNFSF12O43508 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TNFSF12O43508 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TNFSF12O43508 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TNFSF12O43508 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TNFSF12O43508 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TNFSF12O43508 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TNFSF12O43508 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TNFSF12O43508 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TNFSF12O43508 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TNFSF12O43508 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TNFSF12O43508 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms