Protein–RNA interactions for Protein: O43395

PRPF3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF3O43395 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRPF3O43395 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRPF3O43395 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRPF3O43395 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRPF3O43395 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRPF3O43395 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRPF3O43395 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRPF3O43395 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRPF3O43395 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRPF3O43395 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRPF3O43395 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRPF3O43395 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRPF3O43395 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRPF3O43395 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRPF3O43395 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRPF3O43395 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRPF3O43395 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRPF3O43395 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRPF3O43395 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRPF3O43395 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRPF3O43395 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
PRPF3O43395 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRPF3O43395 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRPF3O43395 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRPF3O43395 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRPF3O43395 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PRPF3O43395 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PRPF3O43395 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
PRPF3O43395 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PRPF3O43395 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRPF3O43395 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRPF3O43395 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRPF3O43395 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRPF3O43395 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRPF3O43395 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRPF3O43395 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRPF3O43395 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRPF3O43395 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRPF3O43395 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRPF3O43395 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRPF3O43395 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
PRPF3O43395 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRPF3O43395 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRPF3O43395 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRPF3O43395 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRPF3O43395 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRPF3O43395 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRPF3O43395 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRPF3O43395 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRPF3O43395 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRPF3O43395 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
PRPF3O43395 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRPF3O43395 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRPF3O43395 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
PRPF3O43395 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRPF3O43395 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRPF3O43395 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRPF3O43395 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRPF3O43395 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRPF3O43395 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRPF3O43395 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
PRPF3O43395 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRPF3O43395 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRPF3O43395 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRPF3O43395 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRPF3O43395 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRPF3O43395 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRPF3O43395 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
PRPF3O43395 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRPF3O43395 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRPF3O43395 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRPF3O43395 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRPF3O43395 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRPF3O43395 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRPF3O43395 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRPF3O43395 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRPF3O43395 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRPF3O43395 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRPF3O43395 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRPF3O43395 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRPF3O43395 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRPF3O43395 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRPF3O43395 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRPF3O43395 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRPF3O43395 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRPF3O43395 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PRPF3O43395 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRPF3O43395 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRPF3O43395 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRPF3O43395 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PRPF3O43395 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRPF3O43395 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRPF3O43395 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRPF3O43395 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRPF3O43395 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRPF3O43395 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRPF3O43395 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRPF3O43395 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRPF3O43395 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRPF3O43395 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 257.8 ms