Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC35.84■■■■□ 3.33
SYNMO15061 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
SYNMO15061 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC35.84■■■■□ 3.33
SYNMO15061 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
SYNMO15061 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
SYNMO15061 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
SYNMO15061 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
SYNMO15061 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC35.82■■■■□ 3.32
SYNMO15061 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
SYNMO15061 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
SYNMO15061 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
SYNMO15061 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
SYNMO15061 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
SYNMO15061 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
SYNMO15061 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
SYNMO15061 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
SYNMO15061 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
SYNMO15061 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
SYNMO15061 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
SYNMO15061 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
SYNMO15061 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
SYNMO15061 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
SYNMO15061 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
SYNMO15061 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
SYNMO15061 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
SYNMO15061 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
SYNMO15061 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
SYNMO15061 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
SYNMO15061 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
SYNMO15061 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.77■■■■□ 3.32
SYNMO15061 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
SYNMO15061 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
SYNMO15061 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
SYNMO15061 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
SYNMO15061 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
SYNMO15061 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
SYNMO15061 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.31
SYNMO15061 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.31
SYNMO15061 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
SYNMO15061 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
SYNMO15061 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
SYNMO15061 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
SYNMO15061 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
SYNMO15061 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
SYNMO15061 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
SYNMO15061 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
SYNMO15061 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
SYNMO15061 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.74■■■■□ 3.31
SYNMO15061 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
SYNMO15061 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
SYNMO15061 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
SYNMO15061 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC35.72■■■■□ 3.31
SYNMO15061 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
SYNMO15061 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
SYNMO15061 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
SYNMO15061 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
SYNMO15061 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
SYNMO15061 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC35.69■■■■□ 3.3
SYNMO15061 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
SYNMO15061 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
SYNMO15061 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
SYNMO15061 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
SYNMO15061 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC35.68■■■■□ 3.3
SYNMO15061 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
SYNMO15061 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
SYNMO15061 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
SYNMO15061 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
SYNMO15061 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
SYNMO15061 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
SYNMO15061 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
SYNMO15061 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
SYNMO15061 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
SYNMO15061 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
SYNMO15061 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
SYNMO15061 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
SYNMO15061 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
SYNMO15061 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC35.65■■■■□ 3.3
SYNMO15061 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
SYNMO15061 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
SYNMO15061 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC35.64■■■■□ 3.3
SYNMO15061 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
SYNMO15061 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
SYNMO15061 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
SYNMO15061 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
SYNMO15061 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
SYNMO15061 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
SYNMO15061 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
SYNMO15061 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
SYNMO15061 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
SYNMO15061 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
SYNMO15061 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
SYNMO15061 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
SYNMO15061 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
SYNMO15061 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
SYNMO15061 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
SYNMO15061 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
SYNMO15061 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
SYNMO15061 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
SYNMO15061 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
SYNMO15061 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms