Protein–RNA interactions for Protein: O14896

IRF6, Interferon regulatory factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF6O14896 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
IRF6O14896 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
IRF6O14896 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
IRF6O14896 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
IRF6O14896 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
IRF6O14896 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
IRF6O14896 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
IRF6O14896 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
IRF6O14896 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
IRF6O14896 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
IRF6O14896 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
IRF6O14896 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
IRF6O14896 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
IRF6O14896 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
IRF6O14896 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
IRF6O14896 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
IRF6O14896 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
IRF6O14896 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
IRF6O14896 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
IRF6O14896 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
IRF6O14896 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
IRF6O14896 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
IRF6O14896 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
IRF6O14896 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
IRF6O14896 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.17
IRF6O14896 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
IRF6O14896 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
IRF6O14896 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
IRF6O14896 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
IRF6O14896 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
IRF6O14896 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
IRF6O14896 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
IRF6O14896 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
IRF6O14896 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
IRF6O14896 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
IRF6O14896 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
IRF6O14896 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
IRF6O14896 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
IRF6O14896 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
IRF6O14896 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
IRF6O14896 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
IRF6O14896 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
IRF6O14896 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
IRF6O14896 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
IRF6O14896 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
IRF6O14896 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
IRF6O14896 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
IRF6O14896 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
IRF6O14896 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
IRF6O14896 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
IRF6O14896 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
IRF6O14896 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
IRF6O14896 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
IRF6O14896 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
IRF6O14896 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
IRF6O14896 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
IRF6O14896 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
IRF6O14896 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
IRF6O14896 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
IRF6O14896 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
IRF6O14896 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
IRF6O14896 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
IRF6O14896 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
IRF6O14896 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
IRF6O14896 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
IRF6O14896 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
IRF6O14896 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
IRF6O14896 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
IRF6O14896 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
IRF6O14896 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
IRF6O14896 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
IRF6O14896 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
IRF6O14896 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
IRF6O14896 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
IRF6O14896 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
IRF6O14896 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
IRF6O14896 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
IRF6O14896 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
IRF6O14896 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
IRF6O14896 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
IRF6O14896 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
IRF6O14896 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
IRF6O14896 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
IRF6O14896 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
IRF6O14896 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
IRF6O14896 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
IRF6O14896 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
IRF6O14896 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
IRF6O14896 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
IRF6O14896 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
IRF6O14896 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
IRF6O14896 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
IRF6O14896 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
IRF6O14896 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
IRF6O14896 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
IRF6O14896 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
IRF6O14896 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
IRF6O14896 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
IRF6O14896 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
IRF6O14896 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms