Protein–RNA interactions for Protein: J3QKU1

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QKU1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
J3QKU1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
J3QKU1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
J3QKU1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
J3QKU1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
J3QKU1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
J3QKU1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
J3QKU1 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
J3QKU1 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
J3QKU1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
J3QKU1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
J3QKU1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
J3QKU1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
J3QKU1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
J3QKU1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
J3QKU1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
J3QKU1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
J3QKU1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
J3QKU1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
J3QKU1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
J3QKU1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
J3QKU1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
J3QKU1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
J3QKU1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
J3QKU1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
J3QKU1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
J3QKU1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
J3QKU1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
J3QKU1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
J3QKU1 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
J3QKU1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
J3QKU1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
J3QKU1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
J3QKU1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
J3QKU1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
J3QKU1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
J3QKU1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
J3QKU1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
J3QKU1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
J3QKU1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
J3QKU1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
J3QKU1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
J3QKU1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
J3QKU1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
J3QKU1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
J3QKU1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
J3QKU1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
J3QKU1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
J3QKU1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
J3QKU1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
J3QKU1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
J3QKU1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
J3QKU1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
J3QKU1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
J3QKU1 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
J3QKU1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
J3QKU1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
J3QKU1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
J3QKU1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
J3QKU1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
J3QKU1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
J3QKU1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
J3QKU1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
J3QKU1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
J3QKU1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
J3QKU1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
J3QKU1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
J3QKU1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
J3QKU1 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
J3QKU1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
J3QKU1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
J3QKU1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
J3QKU1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
J3QKU1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
J3QKU1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
J3QKU1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
J3QKU1 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
J3QKU1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
J3QKU1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
J3QKU1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
J3QKU1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
J3QKU1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
J3QKU1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
J3QKU1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
J3QKU1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
J3QKU1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
J3QKU1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
J3QKU1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
J3QKU1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
J3QKU1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
J3QKU1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
J3QKU1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
J3QKU1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
J3QKU1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
J3QKU1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
J3QKU1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
J3QKU1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
J3QKU1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
J3QKU1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
J3QKU1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.2 ms