Protein–RNA interactions for Protein: D6REC4

CFAP99, Cilia- and flagella-associated protein 99, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP99D6REC4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFAP99D6REC4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFAP99D6REC4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CFAP99D6REC4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFAP99D6REC4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFAP99D6REC4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFAP99D6REC4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CFAP99D6REC4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CFAP99D6REC4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CFAP99D6REC4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CFAP99D6REC4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CFAP99D6REC4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CFAP99D6REC4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CFAP99D6REC4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CFAP99D6REC4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CFAP99D6REC4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CFAP99D6REC4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CFAP99D6REC4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CFAP99D6REC4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CFAP99D6REC4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CFAP99D6REC4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CFAP99D6REC4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CFAP99D6REC4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CFAP99D6REC4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CFAP99D6REC4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CFAP99D6REC4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CFAP99D6REC4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CFAP99D6REC4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CFAP99D6REC4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CFAP99D6REC4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CFAP99D6REC4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CFAP99D6REC4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CFAP99D6REC4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CFAP99D6REC4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CFAP99D6REC4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CFAP99D6REC4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CFAP99D6REC4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CFAP99D6REC4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CFAP99D6REC4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CFAP99D6REC4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CFAP99D6REC4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CFAP99D6REC4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CFAP99D6REC4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CFAP99D6REC4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CFAP99D6REC4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFAP99D6REC4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFAP99D6REC4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFAP99D6REC4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFAP99D6REC4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFAP99D6REC4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFAP99D6REC4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFAP99D6REC4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFAP99D6REC4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFAP99D6REC4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFAP99D6REC4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFAP99D6REC4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFAP99D6REC4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFAP99D6REC4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP99D6REC4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP99D6REC4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP99D6REC4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP99D6REC4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP99D6REC4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP99D6REC4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP99D6REC4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP99D6REC4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP99D6REC4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP99D6REC4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP99D6REC4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP99D6REC4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP99D6REC4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP99D6REC4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP99D6REC4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CFAP99D6REC4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CFAP99D6REC4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CFAP99D6REC4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CFAP99D6REC4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CFAP99D6REC4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CFAP99D6REC4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CFAP99D6REC4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CFAP99D6REC4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CFAP99D6REC4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFAP99D6REC4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFAP99D6REC4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFAP99D6REC4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFAP99D6REC4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CFAP99D6REC4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CFAP99D6REC4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CFAP99D6REC4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CFAP99D6REC4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CFAP99D6REC4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CFAP99D6REC4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CFAP99D6REC4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CFAP99D6REC4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CFAP99D6REC4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CFAP99D6REC4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CFAP99D6REC4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CFAP99D6REC4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CFAP99D6REC4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CFAP99D6REC4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms