Protein–RNA interactions for Protein: B4DZS4

TCP11X1, T-complex protein 11 X-linked protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP11X1B4DZS4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TCP11X1B4DZS4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TCP11X1B4DZS4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TCP11X1B4DZS4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TCP11X1B4DZS4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TCP11X1B4DZS4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TCP11X1B4DZS4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TCP11X1B4DZS4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TCP11X1B4DZS4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TCP11X1B4DZS4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TCP11X1B4DZS4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TCP11X1B4DZS4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TCP11X1B4DZS4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TCP11X1B4DZS4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TCP11X1B4DZS4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TCP11X1B4DZS4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TCP11X1B4DZS4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TCP11X1B4DZS4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TCP11X1B4DZS4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TCP11X1B4DZS4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TCP11X1B4DZS4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TCP11X1B4DZS4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TCP11X1B4DZS4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TCP11X1B4DZS4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TCP11X1B4DZS4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TCP11X1B4DZS4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TCP11X1B4DZS4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TCP11X1B4DZS4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TCP11X1B4DZS4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCP11X1B4DZS4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCP11X1B4DZS4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCP11X1B4DZS4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCP11X1B4DZS4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCP11X1B4DZS4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCP11X1B4DZS4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCP11X1B4DZS4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TCP11X1B4DZS4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TCP11X1B4DZS4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TCP11X1B4DZS4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TCP11X1B4DZS4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TCP11X1B4DZS4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TCP11X1B4DZS4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TCP11X1B4DZS4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TCP11X1B4DZS4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TCP11X1B4DZS4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TCP11X1B4DZS4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TCP11X1B4DZS4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TCP11X1B4DZS4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TCP11X1B4DZS4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TCP11X1B4DZS4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TCP11X1B4DZS4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TCP11X1B4DZS4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TCP11X1B4DZS4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TCP11X1B4DZS4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TCP11X1B4DZS4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TCP11X1B4DZS4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TCP11X1B4DZS4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCP11X1B4DZS4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCP11X1B4DZS4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCP11X1B4DZS4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TCP11X1B4DZS4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCP11X1B4DZS4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCP11X1B4DZS4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCP11X1B4DZS4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCP11X1B4DZS4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCP11X1B4DZS4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCP11X1B4DZS4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCP11X1B4DZS4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCP11X1B4DZS4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCP11X1B4DZS4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCP11X1B4DZS4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TCP11X1B4DZS4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCP11X1B4DZS4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCP11X1B4DZS4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TCP11X1B4DZS4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCP11X1B4DZS4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCP11X1B4DZS4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCP11X1B4DZS4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCP11X1B4DZS4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TCP11X1B4DZS4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TCP11X1B4DZS4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCP11X1B4DZS4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCP11X1B4DZS4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCP11X1B4DZS4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCP11X1B4DZS4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCP11X1B4DZS4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCP11X1B4DZS4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCP11X1B4DZS4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCP11X1B4DZS4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TCP11X1B4DZS4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TCP11X1B4DZS4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TCP11X1B4DZS4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TCP11X1B4DZS4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TCP11X1B4DZS4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TCP11X1B4DZS4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TCP11X1B4DZS4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TCP11X1B4DZS4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TCP11X1B4DZS4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TCP11X1B4DZS4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TCP11X1B4DZS4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms