Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00587B1AMM8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00587B1AMM8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00587B1AMM8 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00587B1AMM8 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00587B1AMM8 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00587B1AMM8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00587B1AMM8 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00587B1AMM8 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00587B1AMM8 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00587B1AMM8 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00587B1AMM8 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00587B1AMM8 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00587B1AMM8 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00587B1AMM8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00587B1AMM8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00587B1AMM8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00587B1AMM8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00587B1AMM8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00587B1AMM8 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00587B1AMM8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00587B1AMM8 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00587B1AMM8 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00587B1AMM8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00587B1AMM8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00587B1AMM8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00587B1AMM8 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00587B1AMM8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00587B1AMM8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00587B1AMM8 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00587B1AMM8 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00587B1AMM8 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00587B1AMM8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00587B1AMM8 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00587B1AMM8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00587B1AMM8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00587B1AMM8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00587B1AMM8 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00587B1AMM8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00587B1AMM8 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00587B1AMM8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00587B1AMM8 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00587B1AMM8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00587B1AMM8 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00587B1AMM8 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00587B1AMM8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00587B1AMM8 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00587B1AMM8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00587B1AMM8 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00587B1AMM8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00587B1AMM8 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00587B1AMM8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00587B1AMM8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00587B1AMM8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00587B1AMM8 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00587B1AMM8 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00587B1AMM8 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00587B1AMM8 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00587B1AMM8 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00587B1AMM8 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00587B1AMM8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00587B1AMM8 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00587B1AMM8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00587B1AMM8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00587B1AMM8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00587B1AMM8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00587B1AMM8 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00587B1AMM8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00587B1AMM8 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00587B1AMM8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00587B1AMM8 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00587B1AMM8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00587B1AMM8 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00587B1AMM8 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00587B1AMM8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00587B1AMM8 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00587B1AMM8 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00587B1AMM8 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00587B1AMM8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00587B1AMM8 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00587B1AMM8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00587B1AMM8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00587B1AMM8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00587B1AMM8 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00587B1AMM8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00587B1AMM8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00587B1AMM8 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00587B1AMM8 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00587B1AMM8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00587B1AMM8 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00587B1AMM8 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00587B1AMM8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00587B1AMM8 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00587B1AMM8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00587B1AMM8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00587B1AMM8 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00587B1AMM8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00587B1AMM8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00587B1AMM8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00587B1AMM8 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms