Protein–RNA interactions for Protein: B1AKI9

ISM1, Isthmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISM1B1AKI9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ISM1B1AKI9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ISM1B1AKI9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ISM1B1AKI9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ISM1B1AKI9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ISM1B1AKI9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ISM1B1AKI9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ISM1B1AKI9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ISM1B1AKI9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ISM1B1AKI9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ISM1B1AKI9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ISM1B1AKI9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ISM1B1AKI9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ISM1B1AKI9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ISM1B1AKI9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ISM1B1AKI9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ISM1B1AKI9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ISM1B1AKI9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ISM1B1AKI9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ISM1B1AKI9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ISM1B1AKI9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ISM1B1AKI9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ISM1B1AKI9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ISM1B1AKI9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ISM1B1AKI9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ISM1B1AKI9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ISM1B1AKI9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ISM1B1AKI9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ISM1B1AKI9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ISM1B1AKI9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ISM1B1AKI9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ISM1B1AKI9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ISM1B1AKI9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ISM1B1AKI9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ISM1B1AKI9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ISM1B1AKI9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ISM1B1AKI9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ISM1B1AKI9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ISM1B1AKI9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ISM1B1AKI9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ISM1B1AKI9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ISM1B1AKI9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ISM1B1AKI9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ISM1B1AKI9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ISM1B1AKI9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ISM1B1AKI9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ISM1B1AKI9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ISM1B1AKI9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ISM1B1AKI9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ISM1B1AKI9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ISM1B1AKI9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ISM1B1AKI9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ISM1B1AKI9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ISM1B1AKI9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ISM1B1AKI9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ISM1B1AKI9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ISM1B1AKI9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ISM1B1AKI9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ISM1B1AKI9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ISM1B1AKI9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ISM1B1AKI9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ISM1B1AKI9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ISM1B1AKI9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ISM1B1AKI9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ISM1B1AKI9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ISM1B1AKI9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ISM1B1AKI9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ISM1B1AKI9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ISM1B1AKI9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ISM1B1AKI9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ISM1B1AKI9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ISM1B1AKI9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ISM1B1AKI9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ISM1B1AKI9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ISM1B1AKI9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ISM1B1AKI9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ISM1B1AKI9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ISM1B1AKI9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ISM1B1AKI9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ISM1B1AKI9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ISM1B1AKI9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ISM1B1AKI9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ISM1B1AKI9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ISM1B1AKI9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ISM1B1AKI9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ISM1B1AKI9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ISM1B1AKI9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ISM1B1AKI9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ISM1B1AKI9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ISM1B1AKI9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ISM1B1AKI9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ISM1B1AKI9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ISM1B1AKI9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ISM1B1AKI9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ISM1B1AKI9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ISM1B1AKI9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ISM1B1AKI9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ISM1B1AKI9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ISM1B1AKI9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ISM1B1AKI9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms