Protein–RNA interactions for Protein: A8MV65

VGLL3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL3A8MV65 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VGLL3A8MV65 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VGLL3A8MV65 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VGLL3A8MV65 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VGLL3A8MV65 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VGLL3A8MV65 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VGLL3A8MV65 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VGLL3A8MV65 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VGLL3A8MV65 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VGLL3A8MV65 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VGLL3A8MV65 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
VGLL3A8MV65 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VGLL3A8MV65 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VGLL3A8MV65 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VGLL3A8MV65 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VGLL3A8MV65 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VGLL3A8MV65 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VGLL3A8MV65 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VGLL3A8MV65 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
VGLL3A8MV65 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
VGLL3A8MV65 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VGLL3A8MV65 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VGLL3A8MV65 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VGLL3A8MV65 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VGLL3A8MV65 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
VGLL3A8MV65 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
VGLL3A8MV65 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
VGLL3A8MV65 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VGLL3A8MV65 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VGLL3A8MV65 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VGLL3A8MV65 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VGLL3A8MV65 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VGLL3A8MV65 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VGLL3A8MV65 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VGLL3A8MV65 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VGLL3A8MV65 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VGLL3A8MV65 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
VGLL3A8MV65 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
VGLL3A8MV65 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
VGLL3A8MV65 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
VGLL3A8MV65 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VGLL3A8MV65 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VGLL3A8MV65 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VGLL3A8MV65 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VGLL3A8MV65 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VGLL3A8MV65 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VGLL3A8MV65 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VGLL3A8MV65 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VGLL3A8MV65 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VGLL3A8MV65 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VGLL3A8MV65 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VGLL3A8MV65 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VGLL3A8MV65 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VGLL3A8MV65 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VGLL3A8MV65 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VGLL3A8MV65 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VGLL3A8MV65 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VGLL3A8MV65 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
VGLL3A8MV65 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VGLL3A8MV65 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VGLL3A8MV65 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VGLL3A8MV65 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VGLL3A8MV65 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VGLL3A8MV65 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VGLL3A8MV65 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VGLL3A8MV65 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VGLL3A8MV65 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VGLL3A8MV65 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VGLL3A8MV65 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VGLL3A8MV65 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VGLL3A8MV65 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VGLL3A8MV65 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VGLL3A8MV65 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VGLL3A8MV65 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VGLL3A8MV65 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VGLL3A8MV65 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VGLL3A8MV65 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VGLL3A8MV65 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VGLL3A8MV65 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VGLL3A8MV65 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VGLL3A8MV65 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VGLL3A8MV65 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VGLL3A8MV65 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VGLL3A8MV65 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VGLL3A8MV65 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VGLL3A8MV65 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VGLL3A8MV65 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VGLL3A8MV65 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VGLL3A8MV65 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VGLL3A8MV65 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VGLL3A8MV65 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VGLL3A8MV65 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VGLL3A8MV65 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VGLL3A8MV65 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VGLL3A8MV65 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VGLL3A8MV65 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VGLL3A8MV65 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VGLL3A8MV65 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
VGLL3A8MV65 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VGLL3A8MV65 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms