Protein–RNA interactions for Protein: A6NNZ2

Tubulin beta-8 chain-like protein LOC260334, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NNZ2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
A6NNZ2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
A6NNZ2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
A6NNZ2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
A6NNZ2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
A6NNZ2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
A6NNZ2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
A6NNZ2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
A6NNZ2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
A6NNZ2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
A6NNZ2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
A6NNZ2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
A6NNZ2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
A6NNZ2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
A6NNZ2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
A6NNZ2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
A6NNZ2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
A6NNZ2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
A6NNZ2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
A6NNZ2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
A6NNZ2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
A6NNZ2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
A6NNZ2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
A6NNZ2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
A6NNZ2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
A6NNZ2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
A6NNZ2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
A6NNZ2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
A6NNZ2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
A6NNZ2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
A6NNZ2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
A6NNZ2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
A6NNZ2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
A6NNZ2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
A6NNZ2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
A6NNZ2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
A6NNZ2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
A6NNZ2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
A6NNZ2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
A6NNZ2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
A6NNZ2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
A6NNZ2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
A6NNZ2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
A6NNZ2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
A6NNZ2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
A6NNZ2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
A6NNZ2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
A6NNZ2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
A6NNZ2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
A6NNZ2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
A6NNZ2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
A6NNZ2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
A6NNZ2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
A6NNZ2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
A6NNZ2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
A6NNZ2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
A6NNZ2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
A6NNZ2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
A6NNZ2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
A6NNZ2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
A6NNZ2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
A6NNZ2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
A6NNZ2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
A6NNZ2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
A6NNZ2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
A6NNZ2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
A6NNZ2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
A6NNZ2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
A6NNZ2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
A6NNZ2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
A6NNZ2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
A6NNZ2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
A6NNZ2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
A6NNZ2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
A6NNZ2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
A6NNZ2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
A6NNZ2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
A6NNZ2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
A6NNZ2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
A6NNZ2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
A6NNZ2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
A6NNZ2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
A6NNZ2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
A6NNZ2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
A6NNZ2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
A6NNZ2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
A6NNZ2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
A6NNZ2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
A6NNZ2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
A6NNZ2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
A6NNZ2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
A6NNZ2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
A6NNZ2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
A6NNZ2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
A6NNZ2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
A6NNZ2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
A6NNZ2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
A6NNZ2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
A6NNZ2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
A6NNZ2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms