Protein–RNA interactions for Protein: A6NHC0

CAPN8, Calpain-8, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN8A6NHC0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CAPN8A6NHC0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CAPN8A6NHC0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CAPN8A6NHC0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CAPN8A6NHC0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPN8A6NHC0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPN8A6NHC0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPN8A6NHC0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPN8A6NHC0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPN8A6NHC0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPN8A6NHC0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPN8A6NHC0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAPN8A6NHC0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAPN8A6NHC0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAPN8A6NHC0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAPN8A6NHC0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAPN8A6NHC0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAPN8A6NHC0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAPN8A6NHC0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPN8A6NHC0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPN8A6NHC0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPN8A6NHC0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPN8A6NHC0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPN8A6NHC0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPN8A6NHC0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPN8A6NHC0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPN8A6NHC0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPN8A6NHC0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPN8A6NHC0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAPN8A6NHC0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAPN8A6NHC0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAPN8A6NHC0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAPN8A6NHC0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CAPN8A6NHC0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAPN8A6NHC0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAPN8A6NHC0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAPN8A6NHC0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAPN8A6NHC0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAPN8A6NHC0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAPN8A6NHC0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CAPN8A6NHC0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAPN8A6NHC0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CAPN8A6NHC0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAPN8A6NHC0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAPN8A6NHC0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAPN8A6NHC0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAPN8A6NHC0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAPN8A6NHC0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAPN8A6NHC0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAPN8A6NHC0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAPN8A6NHC0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAPN8A6NHC0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAPN8A6NHC0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAPN8A6NHC0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CAPN8A6NHC0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAPN8A6NHC0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAPN8A6NHC0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPN8A6NHC0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPN8A6NHC0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPN8A6NHC0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPN8A6NHC0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPN8A6NHC0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPN8A6NHC0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPN8A6NHC0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPN8A6NHC0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPN8A6NHC0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPN8A6NHC0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPN8A6NHC0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAPN8A6NHC0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAPN8A6NHC0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAPN8A6NHC0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAPN8A6NHC0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAPN8A6NHC0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAPN8A6NHC0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAPN8A6NHC0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAPN8A6NHC0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAPN8A6NHC0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAPN8A6NHC0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPN8A6NHC0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPN8A6NHC0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPN8A6NHC0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPN8A6NHC0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPN8A6NHC0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPN8A6NHC0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAPN8A6NHC0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAPN8A6NHC0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAPN8A6NHC0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAPN8A6NHC0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAPN8A6NHC0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CAPN8A6NHC0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAPN8A6NHC0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAPN8A6NHC0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAPN8A6NHC0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAPN8A6NHC0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAPN8A6NHC0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAPN8A6NHC0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAPN8A6NHC0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAPN8A6NHC0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAPN8A6NHC0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CAPN8A6NHC0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.3 ms