Protein–RNA interactions for Protein: A6NDU8

C5orf51, UPF0600 protein C5orf51, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf51A6NDU8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C5orf51A6NDU8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C5orf51A6NDU8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C5orf51A6NDU8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C5orf51A6NDU8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C5orf51A6NDU8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C5orf51A6NDU8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C5orf51A6NDU8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C5orf51A6NDU8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C5orf51A6NDU8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
C5orf51A6NDU8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
C5orf51A6NDU8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C5orf51A6NDU8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C5orf51A6NDU8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C5orf51A6NDU8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C5orf51A6NDU8 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C5orf51A6NDU8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C5orf51A6NDU8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C5orf51A6NDU8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C5orf51A6NDU8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C5orf51A6NDU8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C5orf51A6NDU8 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C5orf51A6NDU8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
C5orf51A6NDU8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C5orf51A6NDU8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C5orf51A6NDU8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C5orf51A6NDU8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C5orf51A6NDU8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C5orf51A6NDU8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C5orf51A6NDU8 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C5orf51A6NDU8 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C5orf51A6NDU8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C5orf51A6NDU8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
C5orf51A6NDU8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C5orf51A6NDU8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C5orf51A6NDU8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C5orf51A6NDU8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C5orf51A6NDU8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C5orf51A6NDU8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C5orf51A6NDU8 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C5orf51A6NDU8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C5orf51A6NDU8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
C5orf51A6NDU8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C5orf51A6NDU8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C5orf51A6NDU8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C5orf51A6NDU8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
C5orf51A6NDU8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C5orf51A6NDU8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C5orf51A6NDU8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C5orf51A6NDU8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
C5orf51A6NDU8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C5orf51A6NDU8 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C5orf51A6NDU8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C5orf51A6NDU8 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C5orf51A6NDU8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C5orf51A6NDU8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C5orf51A6NDU8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C5orf51A6NDU8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C5orf51A6NDU8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C5orf51A6NDU8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C5orf51A6NDU8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C5orf51A6NDU8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C5orf51A6NDU8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C5orf51A6NDU8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C5orf51A6NDU8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C5orf51A6NDU8 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
C5orf51A6NDU8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
C5orf51A6NDU8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C5orf51A6NDU8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C5orf51A6NDU8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C5orf51A6NDU8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C5orf51A6NDU8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C5orf51A6NDU8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C5orf51A6NDU8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C5orf51A6NDU8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C5orf51A6NDU8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C5orf51A6NDU8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C5orf51A6NDU8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
C5orf51A6NDU8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C5orf51A6NDU8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C5orf51A6NDU8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C5orf51A6NDU8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C5orf51A6NDU8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C5orf51A6NDU8 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C5orf51A6NDU8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C5orf51A6NDU8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C5orf51A6NDU8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C5orf51A6NDU8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C5orf51A6NDU8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C5orf51A6NDU8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C5orf51A6NDU8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C5orf51A6NDU8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C5orf51A6NDU8 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C5orf51A6NDU8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C5orf51A6NDU8 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C5orf51A6NDU8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C5orf51A6NDU8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C5orf51A6NDU8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C5orf51A6NDU8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C5orf51A6NDU8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms