Protein–RNA interactions for Protein: A6NDN8

Putative ubiquitin-like protein FUBI-like protein ENSP00000310146, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NDN8 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
A6NDN8 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
A6NDN8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
A6NDN8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
A6NDN8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
A6NDN8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
A6NDN8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
A6NDN8 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
A6NDN8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
A6NDN8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
A6NDN8 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
A6NDN8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
A6NDN8 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
A6NDN8 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
A6NDN8 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
A6NDN8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
A6NDN8 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
A6NDN8 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
A6NDN8 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
A6NDN8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
A6NDN8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
A6NDN8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
A6NDN8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
A6NDN8 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
A6NDN8 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
A6NDN8 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
A6NDN8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
A6NDN8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
A6NDN8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
A6NDN8 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
A6NDN8 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
A6NDN8 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
A6NDN8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
A6NDN8 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
A6NDN8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
A6NDN8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
A6NDN8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
A6NDN8 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
A6NDN8 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
A6NDN8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
A6NDN8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
A6NDN8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
A6NDN8 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
A6NDN8 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
A6NDN8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
A6NDN8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
A6NDN8 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
A6NDN8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
A6NDN8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
A6NDN8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
A6NDN8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
A6NDN8 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
A6NDN8 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
A6NDN8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
A6NDN8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
A6NDN8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
A6NDN8 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
A6NDN8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
A6NDN8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
A6NDN8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
A6NDN8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
A6NDN8 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
A6NDN8 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
A6NDN8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
A6NDN8 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
A6NDN8 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
A6NDN8 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
A6NDN8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
A6NDN8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
A6NDN8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
A6NDN8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
A6NDN8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
A6NDN8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
A6NDN8 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
A6NDN8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
A6NDN8 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
A6NDN8 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
A6NDN8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
A6NDN8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
A6NDN8 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
A6NDN8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
A6NDN8 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
A6NDN8 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
A6NDN8 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
A6NDN8 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
A6NDN8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
A6NDN8 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
A6NDN8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
A6NDN8 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
A6NDN8 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
A6NDN8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
A6NDN8 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
A6NDN8 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
A6NDN8 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
A6NDN8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
A6NDN8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
A6NDN8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
A6NDN8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
A6NDN8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
A6NDN8 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms