Protein–RNA interactions for Protein: A6NCW7

USP17L4, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L4A6NCW7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
USP17L4A6NCW7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
USP17L4A6NCW7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
USP17L4A6NCW7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
USP17L4A6NCW7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
USP17L4A6NCW7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
USP17L4A6NCW7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
USP17L4A6NCW7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
USP17L4A6NCW7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
USP17L4A6NCW7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
USP17L4A6NCW7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
USP17L4A6NCW7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
USP17L4A6NCW7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
USP17L4A6NCW7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
USP17L4A6NCW7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
USP17L4A6NCW7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
USP17L4A6NCW7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
USP17L4A6NCW7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
USP17L4A6NCW7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
USP17L4A6NCW7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
USP17L4A6NCW7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
USP17L4A6NCW7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
USP17L4A6NCW7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
USP17L4A6NCW7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
USP17L4A6NCW7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
USP17L4A6NCW7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
USP17L4A6NCW7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
USP17L4A6NCW7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
USP17L4A6NCW7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
USP17L4A6NCW7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
USP17L4A6NCW7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
USP17L4A6NCW7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
USP17L4A6NCW7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
USP17L4A6NCW7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
USP17L4A6NCW7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
USP17L4A6NCW7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
USP17L4A6NCW7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
USP17L4A6NCW7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
USP17L4A6NCW7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
USP17L4A6NCW7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
USP17L4A6NCW7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
USP17L4A6NCW7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
USP17L4A6NCW7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
USP17L4A6NCW7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
USP17L4A6NCW7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
USP17L4A6NCW7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
USP17L4A6NCW7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
USP17L4A6NCW7 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
USP17L4A6NCW7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
USP17L4A6NCW7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
USP17L4A6NCW7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
USP17L4A6NCW7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
USP17L4A6NCW7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.34
USP17L4A6NCW7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
USP17L4A6NCW7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
USP17L4A6NCW7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
USP17L4A6NCW7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
USP17L4A6NCW7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
USP17L4A6NCW7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
USP17L4A6NCW7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
USP17L4A6NCW7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
USP17L4A6NCW7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
USP17L4A6NCW7 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
USP17L4A6NCW7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
USP17L4A6NCW7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
USP17L4A6NCW7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
USP17L4A6NCW7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
USP17L4A6NCW7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
USP17L4A6NCW7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
USP17L4A6NCW7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
USP17L4A6NCW7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
USP17L4A6NCW7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
USP17L4A6NCW7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
USP17L4A6NCW7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
USP17L4A6NCW7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
USP17L4A6NCW7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
USP17L4A6NCW7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
USP17L4A6NCW7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
USP17L4A6NCW7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
USP17L4A6NCW7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
USP17L4A6NCW7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
USP17L4A6NCW7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
USP17L4A6NCW7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
USP17L4A6NCW7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
USP17L4A6NCW7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
USP17L4A6NCW7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
USP17L4A6NCW7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
USP17L4A6NCW7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
USP17L4A6NCW7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC29.62■■■□□ 2.33
USP17L4A6NCW7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
USP17L4A6NCW7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
USP17L4A6NCW7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
USP17L4A6NCW7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
USP17L4A6NCW7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
USP17L4A6NCW7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
USP17L4A6NCW7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
USP17L4A6NCW7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
USP17L4A6NCW7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
USP17L4A6NCW7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
USP17L4A6NCW7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms