Protein–RNA interactions for Protein: A6NCS4

NKX2-6, Homeobox protein Nkx-2.6, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-6A6NCS4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NKX2-6A6NCS4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NKX2-6A6NCS4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NKX2-6A6NCS4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NKX2-6A6NCS4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NKX2-6A6NCS4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NKX2-6A6NCS4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NKX2-6A6NCS4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NKX2-6A6NCS4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NKX2-6A6NCS4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NKX2-6A6NCS4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NKX2-6A6NCS4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NKX2-6A6NCS4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NKX2-6A6NCS4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NKX2-6A6NCS4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NKX2-6A6NCS4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NKX2-6A6NCS4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NKX2-6A6NCS4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NKX2-6A6NCS4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NKX2-6A6NCS4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NKX2-6A6NCS4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NKX2-6A6NCS4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NKX2-6A6NCS4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NKX2-6A6NCS4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NKX2-6A6NCS4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NKX2-6A6NCS4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NKX2-6A6NCS4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NKX2-6A6NCS4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NKX2-6A6NCS4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NKX2-6A6NCS4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NKX2-6A6NCS4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NKX2-6A6NCS4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NKX2-6A6NCS4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NKX2-6A6NCS4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NKX2-6A6NCS4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NKX2-6A6NCS4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NKX2-6A6NCS4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NKX2-6A6NCS4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NKX2-6A6NCS4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
NKX2-6A6NCS4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NKX2-6A6NCS4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NKX2-6A6NCS4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NKX2-6A6NCS4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NKX2-6A6NCS4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NKX2-6A6NCS4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NKX2-6A6NCS4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NKX2-6A6NCS4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NKX2-6A6NCS4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NKX2-6A6NCS4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NKX2-6A6NCS4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NKX2-6A6NCS4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NKX2-6A6NCS4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NKX2-6A6NCS4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NKX2-6A6NCS4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NKX2-6A6NCS4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NKX2-6A6NCS4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NKX2-6A6NCS4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NKX2-6A6NCS4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NKX2-6A6NCS4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NKX2-6A6NCS4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NKX2-6A6NCS4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NKX2-6A6NCS4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NKX2-6A6NCS4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NKX2-6A6NCS4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NKX2-6A6NCS4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NKX2-6A6NCS4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NKX2-6A6NCS4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NKX2-6A6NCS4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NKX2-6A6NCS4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NKX2-6A6NCS4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NKX2-6A6NCS4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NKX2-6A6NCS4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NKX2-6A6NCS4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NKX2-6A6NCS4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NKX2-6A6NCS4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NKX2-6A6NCS4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NKX2-6A6NCS4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NKX2-6A6NCS4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NKX2-6A6NCS4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NKX2-6A6NCS4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NKX2-6A6NCS4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NKX2-6A6NCS4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NKX2-6A6NCS4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NKX2-6A6NCS4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NKX2-6A6NCS4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NKX2-6A6NCS4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NKX2-6A6NCS4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NKX2-6A6NCS4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NKX2-6A6NCS4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NKX2-6A6NCS4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NKX2-6A6NCS4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NKX2-6A6NCS4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NKX2-6A6NCS4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NKX2-6A6NCS4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NKX2-6A6NCS4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NKX2-6A6NCS4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NKX2-6A6NCS4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NKX2-6A6NCS4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NKX2-6A6NCS4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NKX2-6A6NCS4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms