Protein–RNA interactions for Protein: A6NCK2

TRIM43B, Tripartite motif-containing protein 43B, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM43BA6NCK2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM43BA6NCK2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM43BA6NCK2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM43BA6NCK2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM43BA6NCK2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM43BA6NCK2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM43BA6NCK2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM43BA6NCK2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM43BA6NCK2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM43BA6NCK2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM43BA6NCK2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM43BA6NCK2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM43BA6NCK2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM43BA6NCK2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM43BA6NCK2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM43BA6NCK2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM43BA6NCK2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM43BA6NCK2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM43BA6NCK2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM43BA6NCK2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM43BA6NCK2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM43BA6NCK2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM43BA6NCK2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM43BA6NCK2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM43BA6NCK2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM43BA6NCK2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM43BA6NCK2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM43BA6NCK2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM43BA6NCK2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM43BA6NCK2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM43BA6NCK2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM43BA6NCK2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM43BA6NCK2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27■■□□□ 1.91
TRIM43BA6NCK2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM43BA6NCK2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM43BA6NCK2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM43BA6NCK2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM43BA6NCK2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM43BA6NCK2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM43BA6NCK2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM43BA6NCK2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM43BA6NCK2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM43BA6NCK2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM43BA6NCK2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM43BA6NCK2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM43BA6NCK2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM43BA6NCK2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM43BA6NCK2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM43BA6NCK2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM43BA6NCK2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM43BA6NCK2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM43BA6NCK2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM43BA6NCK2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM43BA6NCK2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM43BA6NCK2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM43BA6NCK2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM43BA6NCK2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM43BA6NCK2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM43BA6NCK2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM43BA6NCK2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM43BA6NCK2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRIM43BA6NCK2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRIM43BA6NCK2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRIM43BA6NCK2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRIM43BA6NCK2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRIM43BA6NCK2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRIM43BA6NCK2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
TRIM43BA6NCK2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRIM43BA6NCK2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRIM43BA6NCK2 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRIM43BA6NCK2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM43BA6NCK2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM43BA6NCK2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM43BA6NCK2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM43BA6NCK2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM43BA6NCK2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM43BA6NCK2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM43BA6NCK2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM43BA6NCK2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM43BA6NCK2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM43BA6NCK2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM43BA6NCK2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM43BA6NCK2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM43BA6NCK2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM43BA6NCK2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM43BA6NCK2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM43BA6NCK2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM43BA6NCK2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM43BA6NCK2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM43BA6NCK2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM43BA6NCK2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM43BA6NCK2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM43BA6NCK2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRIM43BA6NCK2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRIM43BA6NCK2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TRIM43BA6NCK2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
TRIM43BA6NCK2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM43BA6NCK2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM43BA6NCK2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM43BA6NCK2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms