Protein–RNA interactions for Protein: A2RUB6

CCDC66, Coiled-coil domain-containing protein 66, humanhuman

Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC66A2RUB6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC66A2RUB6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC66A2RUB6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC66A2RUB6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC66A2RUB6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC66A2RUB6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC66A2RUB6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC66A2RUB6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC66A2RUB6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC66A2RUB6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC66A2RUB6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC66A2RUB6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC66A2RUB6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC66A2RUB6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC66A2RUB6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC66A2RUB6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC66A2RUB6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC66A2RUB6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC66A2RUB6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC66A2RUB6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC66A2RUB6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC66A2RUB6 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC66A2RUB6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC66A2RUB6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC66A2RUB6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC66A2RUB6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC66A2RUB6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC66A2RUB6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC66A2RUB6 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC66A2RUB6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC66A2RUB6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC66A2RUB6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC66A2RUB6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC66A2RUB6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC66A2RUB6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC66A2RUB6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC66A2RUB6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC66A2RUB6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC66A2RUB6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC66A2RUB6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC66A2RUB6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC66A2RUB6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC66A2RUB6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC66A2RUB6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC66A2RUB6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC66A2RUB6 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC66A2RUB6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC66A2RUB6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC66A2RUB6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC66A2RUB6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC66A2RUB6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC66A2RUB6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC66A2RUB6 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC66A2RUB6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC66A2RUB6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCDC66A2RUB6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC66A2RUB6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC66A2RUB6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC66A2RUB6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC66A2RUB6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC66A2RUB6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC66A2RUB6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC66A2RUB6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC66A2RUB6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC66A2RUB6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC66A2RUB6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC66A2RUB6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC66A2RUB6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC66A2RUB6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC66A2RUB6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC66A2RUB6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC66A2RUB6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC66A2RUB6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC66A2RUB6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC66A2RUB6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC66A2RUB6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC66A2RUB6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC66A2RUB6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC66A2RUB6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC66A2RUB6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC66A2RUB6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC66A2RUB6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC66A2RUB6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC66A2RUB6 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC66A2RUB6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC66A2RUB6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC66A2RUB6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC66A2RUB6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC66A2RUB6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC66A2RUB6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC66A2RUB6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC66A2RUB6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC66A2RUB6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC66A2RUB6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC66A2RUB6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC66A2RUB6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC66A2RUB6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC66A2RUB6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC66A2RUB6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC66A2RUB6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms