Protein–RNA interactions for Protein: A1X283

SH3PXD2B, SH3 and PX domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3PXD2BA1X283 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SH3PXD2BA1X283 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SH3PXD2BA1X283 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SH3PXD2BA1X283 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SH3PXD2BA1X283 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SH3PXD2BA1X283 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH3PXD2BA1X283 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH3PXD2BA1X283 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH3PXD2BA1X283 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH3PXD2BA1X283 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH3PXD2BA1X283 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH3PXD2BA1X283 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SH3PXD2BA1X283 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SH3PXD2BA1X283 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SH3PXD2BA1X283 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SH3PXD2BA1X283 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SH3PXD2BA1X283 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH3PXD2BA1X283 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH3PXD2BA1X283 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH3PXD2BA1X283 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH3PXD2BA1X283 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH3PXD2BA1X283 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH3PXD2BA1X283 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH3PXD2BA1X283 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SH3PXD2BA1X283 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH3PXD2BA1X283 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3PXD2BA1X283 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3PXD2BA1X283 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3PXD2BA1X283 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3PXD2BA1X283 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3PXD2BA1X283 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3PXD2BA1X283 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3PXD2BA1X283 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH3PXD2BA1X283 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH3PXD2BA1X283 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH3PXD2BA1X283 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH3PXD2BA1X283 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH3PXD2BA1X283 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SH3PXD2BA1X283 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SH3PXD2BA1X283 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SH3PXD2BA1X283 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SH3PXD2BA1X283 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SH3PXD2BA1X283 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SH3PXD2BA1X283 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SH3PXD2BA1X283 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SH3PXD2BA1X283 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SH3PXD2BA1X283 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SH3PXD2BA1X283 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SH3PXD2BA1X283 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SH3PXD2BA1X283 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SH3PXD2BA1X283 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SH3PXD2BA1X283 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SH3PXD2BA1X283 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SH3PXD2BA1X283 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SH3PXD2BA1X283 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SH3PXD2BA1X283 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SH3PXD2BA1X283 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SH3PXD2BA1X283 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SH3PXD2BA1X283 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SH3PXD2BA1X283 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SH3PXD2BA1X283 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH3PXD2BA1X283 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH3PXD2BA1X283 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH3PXD2BA1X283 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SH3PXD2BA1X283 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH3PXD2BA1X283 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH3PXD2BA1X283 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SH3PXD2BA1X283 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SH3PXD2BA1X283 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SH3PXD2BA1X283 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SH3PXD2BA1X283 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SH3PXD2BA1X283 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SH3PXD2BA1X283 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SH3PXD2BA1X283 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SH3PXD2BA1X283 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SH3PXD2BA1X283 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SH3PXD2BA1X283 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SH3PXD2BA1X283 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SH3PXD2BA1X283 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SH3PXD2BA1X283 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SH3PXD2BA1X283 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SH3PXD2BA1X283 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SH3PXD2BA1X283 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SH3PXD2BA1X283 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SH3PXD2BA1X283 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SH3PXD2BA1X283 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH3PXD2BA1X283 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH3PXD2BA1X283 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH3PXD2BA1X283 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH3PXD2BA1X283 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH3PXD2BA1X283 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH3PXD2BA1X283 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH3PXD2BA1X283 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH3PXD2BA1X283 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH3PXD2BA1X283 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3PXD2BA1X283 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3PXD2BA1X283 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3PXD2BA1X283 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3PXD2BA1X283 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3PXD2BA1X283 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms