Protein–RNA interactions for Protein: A0AV96

RBM47, RNA-binding protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM47A0AV96 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
RBM47A0AV96 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
RBM47A0AV96 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RBM47A0AV96 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
RBM47A0AV96 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
RBM47A0AV96 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RBM47A0AV96 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RBM47A0AV96 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RBM47A0AV96 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.55■■■□□ 2
RBM47A0AV96 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RBM47A0AV96 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RBM47A0AV96 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RBM47A0AV96 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RBM47A0AV96 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RBM47A0AV96 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RBM47A0AV96 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.54■■■□□ 2
RBM47A0AV96 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.54■■■□□ 2
RBM47A0AV96 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RBM47A0AV96 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.53■■■□□ 2
RBM47A0AV96 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RBM47A0AV96 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RBM47A0AV96 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RBM47A0AV96 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RBM47A0AV96 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RBM47A0AV96 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RBM47A0AV96 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RBM47A0AV96 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RBM47A0AV96 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RBM47A0AV96 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RBM47A0AV96 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RBM47A0AV96 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RBM47A0AV96 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
RBM47A0AV96 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RBM47A0AV96 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RBM47A0AV96 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RBM47A0AV96 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RBM47A0AV96 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RBM47A0AV96 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RBM47A0AV96 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RBM47A0AV96 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RBM47A0AV96 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RBM47A0AV96 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RBM47A0AV96 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RBM47A0AV96 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RBM47A0AV96 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RBM47A0AV96 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RBM47A0AV96 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RBM47A0AV96 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
RBM47A0AV96 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RBM47A0AV96 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
RBM47A0AV96 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RBM47A0AV96 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RBM47A0AV96 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RBM47A0AV96 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RBM47A0AV96 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RBM47A0AV96 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RBM47A0AV96 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RBM47A0AV96 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RBM47A0AV96 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RBM47A0AV96 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RBM47A0AV96 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RBM47A0AV96 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RBM47A0AV96 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RBM47A0AV96 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RBM47A0AV96 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RBM47A0AV96 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RBM47A0AV96 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RBM47A0AV96 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RBM47A0AV96 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
RBM47A0AV96 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RBM47A0AV96 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
RBM47A0AV96 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RBM47A0AV96 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RBM47A0AV96 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RBM47A0AV96 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RBM47A0AV96 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RBM47A0AV96 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RBM47A0AV96 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RBM47A0AV96 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RBM47A0AV96 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RBM47A0AV96 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RBM47A0AV96 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RBM47A0AV96 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RBM47A0AV96 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RBM47A0AV96 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RBM47A0AV96 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RBM47A0AV96 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RBM47A0AV96 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RBM47A0AV96 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RBM47A0AV96 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RBM47A0AV96 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RBM47A0AV96 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RBM47A0AV96 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RBM47A0AV96 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RBM47A0AV96 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RBM47A0AV96 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
RBM47A0AV96 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RBM47A0AV96 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RBM47A0AV96 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RBM47A0AV96 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms