Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3C4

TPRKB, EKC/KEOPS complex subunit TPRKB, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRKBQ9Y3C4 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TPRKBQ9Y3C4 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms