Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y285

FARSA, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARSAQ9Y285 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FARSAQ9Y285 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FARSAQ9Y285 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FARSAQ9Y285 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FARSAQ9Y285 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
FARSAQ9Y285 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FARSAQ9Y285 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FARSAQ9Y285 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FARSAQ9Y285 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
FARSAQ9Y285 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FARSAQ9Y285 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FARSAQ9Y285 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FARSAQ9Y285 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FARSAQ9Y285 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FARSAQ9Y285 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FARSAQ9Y285 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FARSAQ9Y285 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms