Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAK1Q9UPV9 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAK1Q9UPV9 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms