Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms