Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TFIP11Q9UBB9 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms