Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J0

NDUFA13, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA13Q9P0J0 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NDUFA13Q9P0J0 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDUFA13Q9P0J0 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms