Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
KLHL28Q9NXS3 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL28Q9NXS3 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL28Q9NXS3 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL28Q9NXS3 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL28Q9NXS3 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL28Q9NXS3 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL28Q9NXS3 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL28Q9NXS3 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL28Q9NXS3 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL28Q9NXS3 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL28Q9NXS3 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL28Q9NXS3 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL28Q9NXS3 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL28Q9NXS3 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL28Q9NXS3 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL28Q9NXS3 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL28Q9NXS3 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL28Q9NXS3 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL28Q9NXS3 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL28Q9NXS3 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL28Q9NXS3 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL28Q9NXS3 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL28Q9NXS3 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL28Q9NXS3 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL28Q9NXS3 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL28Q9NXS3 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL28Q9NXS3 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL28Q9NXS3 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL28Q9NXS3 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL28Q9NXS3 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL28Q9NXS3 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL28Q9NXS3 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL28Q9NXS3 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL28Q9NXS3 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL28Q9NXS3 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL28Q9NXS3 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL28Q9NXS3 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL28Q9NXS3 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL28Q9NXS3 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL28Q9NXS3 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms