Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX47

MARCH5, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH5, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH5Q9NX47 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MARCH5Q9NX47 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MARCH5Q9NX47 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MARCH5Q9NX47 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MARCH5Q9NX47 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MARCH5Q9NX47 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MARCH5Q9NX47 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MARCH5Q9NX47 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MARCH5Q9NX47 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MARCH5Q9NX47 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MARCH5Q9NX47 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MARCH5Q9NX47 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MARCH5Q9NX47 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MARCH5Q9NX47 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MARCH5Q9NX47 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MARCH5Q9NX47 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MARCH5Q9NX47 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MARCH5Q9NX47 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MARCH5Q9NX47 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MARCH5Q9NX47 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MARCH5Q9NX47 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MARCH5Q9NX47 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MARCH5Q9NX47 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MARCH5Q9NX47 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MARCH5Q9NX47 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MARCH5Q9NX47 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MARCH5Q9NX47 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MARCH5Q9NX47 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MARCH5Q9NX47 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MARCH5Q9NX47 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MARCH5Q9NX47 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MARCH5Q9NX47 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MARCH5Q9NX47 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MARCH5Q9NX47 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MARCH5Q9NX47 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MARCH5Q9NX47 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MARCH5Q9NX47 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MARCH5Q9NX47 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MARCH5Q9NX47 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MARCH5Q9NX47 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MARCH5Q9NX47 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MARCH5Q9NX47 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MARCH5Q9NX47 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MARCH5Q9NX47 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MARCH5Q9NX47 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MARCH5Q9NX47 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MARCH5Q9NX47 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MARCH5Q9NX47 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MARCH5Q9NX47 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MARCH5Q9NX47 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MARCH5Q9NX47 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MARCH5Q9NX47 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MARCH5Q9NX47 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MARCH5Q9NX47 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MARCH5Q9NX47 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MARCH5Q9NX47 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MARCH5Q9NX47 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MARCH5Q9NX47 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MARCH5Q9NX47 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MARCH5Q9NX47 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MARCH5Q9NX47 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MARCH5Q9NX47 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MARCH5Q9NX47 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MARCH5Q9NX47 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MARCH5Q9NX47 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MARCH5Q9NX47 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MARCH5Q9NX47 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MARCH5Q9NX47 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MARCH5Q9NX47 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MARCH5Q9NX47 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MARCH5Q9NX47 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MARCH5Q9NX47 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MARCH5Q9NX47 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
MARCH5Q9NX47 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MARCH5Q9NX47 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MARCH5Q9NX47 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MARCH5Q9NX47 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MARCH5Q9NX47 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MARCH5Q9NX47 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MARCH5Q9NX47 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MARCH5Q9NX47 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
MARCH5Q9NX47 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MARCH5Q9NX47 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MARCH5Q9NX47 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MARCH5Q9NX47 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MARCH5Q9NX47 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MARCH5Q9NX47 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MARCH5Q9NX47 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
MARCH5Q9NX47 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MARCH5Q9NX47 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MARCH5Q9NX47 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MARCH5Q9NX47 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MARCH5Q9NX47 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MARCH5Q9NX47 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MARCH5Q9NX47 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MARCH5Q9NX47 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MARCH5Q9NX47 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MARCH5Q9NX47 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MARCH5Q9NX47 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
MARCH5Q9NX47 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms