Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms