Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP77

SSU72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72Q9NP77 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSU72Q9NP77 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms