Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2C1

LHX5, LIM/homeobox protein Lhx5, humanhuman

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Length 402 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX5Q9H2C1 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LHX5Q9H2C1 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LHX5Q9H2C1 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LHX5Q9H2C1 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LHX5Q9H2C1 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LHX5Q9H2C1 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LHX5Q9H2C1 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LHX5Q9H2C1 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LHX5Q9H2C1 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LHX5Q9H2C1 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LHX5Q9H2C1 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LHX5Q9H2C1 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LHX5Q9H2C1 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LHX5Q9H2C1 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LHX5Q9H2C1 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LHX5Q9H2C1 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LHX5Q9H2C1 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LHX5Q9H2C1 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LHX5Q9H2C1 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LHX5Q9H2C1 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LHX5Q9H2C1 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LHX5Q9H2C1 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LHX5Q9H2C1 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LHX5Q9H2C1 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LHX5Q9H2C1 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LHX5Q9H2C1 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LHX5Q9H2C1 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LHX5Q9H2C1 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LHX5Q9H2C1 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LHX5Q9H2C1 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LHX5Q9H2C1 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LHX5Q9H2C1 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LHX5Q9H2C1 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LHX5Q9H2C1 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LHX5Q9H2C1 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LHX5Q9H2C1 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LHX5Q9H2C1 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LHX5Q9H2C1 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LHX5Q9H2C1 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LHX5Q9H2C1 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LHX5Q9H2C1 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LHX5Q9H2C1 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LHX5Q9H2C1 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LHX5Q9H2C1 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LHX5Q9H2C1 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LHX5Q9H2C1 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
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