Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE3

BARHL1, BarH-like 1 homeobox protein, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARHL1Q9BZE3 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BARHL1Q9BZE3 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BARHL1Q9BZE3 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BARHL1Q9BZE3 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BARHL1Q9BZE3 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BARHL1Q9BZE3 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BARHL1Q9BZE3 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BARHL1Q9BZE3 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BARHL1Q9BZE3 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BARHL1Q9BZE3 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BARHL1Q9BZE3 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BARHL1Q9BZE3 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BARHL1Q9BZE3 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BARHL1Q9BZE3 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BARHL1Q9BZE3 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
BARHL1Q9BZE3 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BARHL1Q9BZE3 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BARHL1Q9BZE3 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BARHL1Q9BZE3 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BARHL1Q9BZE3 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BARHL1Q9BZE3 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
BARHL1Q9BZE3 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BARHL1Q9BZE3 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BARHL1Q9BZE3 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BARHL1Q9BZE3 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BARHL1Q9BZE3 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BARHL1Q9BZE3 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BARHL1Q9BZE3 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BARHL1Q9BZE3 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BARHL1Q9BZE3 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BARHL1Q9BZE3 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BARHL1Q9BZE3 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BARHL1Q9BZE3 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BARHL1Q9BZE3 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BARHL1Q9BZE3 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BARHL1Q9BZE3 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BARHL1Q9BZE3 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BARHL1Q9BZE3 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
BARHL1Q9BZE3 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BARHL1Q9BZE3 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BARHL1Q9BZE3 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BARHL1Q9BZE3 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BARHL1Q9BZE3 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
BARHL1Q9BZE3 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BARHL1Q9BZE3 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BARHL1Q9BZE3 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BARHL1Q9BZE3 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BARHL1Q9BZE3 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BARHL1Q9BZE3 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BARHL1Q9BZE3 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BARHL1Q9BZE3 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BARHL1Q9BZE3 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BARHL1Q9BZE3 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BARHL1Q9BZE3 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BARHL1Q9BZE3 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BARHL1Q9BZE3 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BARHL1Q9BZE3 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BARHL1Q9BZE3 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BARHL1Q9BZE3 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BARHL1Q9BZE3 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BARHL1Q9BZE3 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BARHL1Q9BZE3 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BARHL1Q9BZE3 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BARHL1Q9BZE3 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
BARHL1Q9BZE3 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BARHL1Q9BZE3 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BARHL1Q9BZE3 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BARHL1Q9BZE3 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BARHL1Q9BZE3 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BARHL1Q9BZE3 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
BARHL1Q9BZE3 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
BARHL1Q9BZE3 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BARHL1Q9BZE3 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BARHL1Q9BZE3 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BARHL1Q9BZE3 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BARHL1Q9BZE3 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BARHL1Q9BZE3 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BARHL1Q9BZE3 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BARHL1Q9BZE3 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BARHL1Q9BZE3 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BARHL1Q9BZE3 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BARHL1Q9BZE3 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BARHL1Q9BZE3 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BARHL1Q9BZE3 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BARHL1Q9BZE3 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BARHL1Q9BZE3 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BARHL1Q9BZE3 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BARHL1Q9BZE3 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BARHL1Q9BZE3 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BARHL1Q9BZE3 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BARHL1Q9BZE3 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BARHL1Q9BZE3 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BARHL1Q9BZE3 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BARHL1Q9BZE3 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BARHL1Q9BZE3 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BARHL1Q9BZE3 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BARHL1Q9BZE3 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BARHL1Q9BZE3 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BARHL1Q9BZE3 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BARHL1Q9BZE3 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms