Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSA9

TMEM175, Endosomal/lysosomal potassium channel TMEM175, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM175Q9BSA9 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM175Q9BSA9 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM175Q9BSA9 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM175Q9BSA9 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM175Q9BSA9 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM175Q9BSA9 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM175Q9BSA9 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM175Q9BSA9 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM175Q9BSA9 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM175Q9BSA9 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM175Q9BSA9 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM175Q9BSA9 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM175Q9BSA9 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM175Q9BSA9 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM175Q9BSA9 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM175Q9BSA9 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM175Q9BSA9 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM175Q9BSA9 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM175Q9BSA9 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM175Q9BSA9 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM175Q9BSA9 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM175Q9BSA9 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM175Q9BSA9 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM175Q9BSA9 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM175Q9BSA9 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM175Q9BSA9 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM175Q9BSA9 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM175Q9BSA9 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM175Q9BSA9 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM175Q9BSA9 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM175Q9BSA9 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM175Q9BSA9 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM175Q9BSA9 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM175Q9BSA9 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM175Q9BSA9 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM175Q9BSA9 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM175Q9BSA9 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM175Q9BSA9 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM175Q9BSA9 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM175Q9BSA9 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM175Q9BSA9 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM175Q9BSA9 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM175Q9BSA9 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM175Q9BSA9 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM175Q9BSA9 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM175Q9BSA9 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM175Q9BSA9 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM175Q9BSA9 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM175Q9BSA9 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM175Q9BSA9 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM175Q9BSA9 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM175Q9BSA9 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM175Q9BSA9 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM175Q9BSA9 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM175Q9BSA9 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM175Q9BSA9 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM175Q9BSA9 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM175Q9BSA9 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM175Q9BSA9 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM175Q9BSA9 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM175Q9BSA9 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM175Q9BSA9 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM175Q9BSA9 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM175Q9BSA9 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM175Q9BSA9 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM175Q9BSA9 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM175Q9BSA9 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM175Q9BSA9 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM175Q9BSA9 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM175Q9BSA9 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM175Q9BSA9 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM175Q9BSA9 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM175Q9BSA9 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM175Q9BSA9 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM175Q9BSA9 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM175Q9BSA9 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM175Q9BSA9 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM175Q9BSA9 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM175Q9BSA9 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM175Q9BSA9 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM175Q9BSA9 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM175Q9BSA9 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM175Q9BSA9 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM175Q9BSA9 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM175Q9BSA9 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM175Q9BSA9 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM175Q9BSA9 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM175Q9BSA9 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM175Q9BSA9 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM175Q9BSA9 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM175Q9BSA9 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM175Q9BSA9 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM175Q9BSA9 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM175Q9BSA9 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM175Q9BSA9 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM175Q9BSA9 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM175Q9BSA9 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM175Q9BSA9 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM175Q9BSA9 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM175Q9BSA9 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms