Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW8

NIPSNAP1, Protein NipSnap homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP1Q9BPW8 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms