Protein–RNA interactions for Protein: Q99732

LITAF, Lipopolysaccharide-induced tumor necrosis factor-alpha factor, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LITAFQ99732 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LITAFQ99732 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LITAFQ99732 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LITAFQ99732 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LITAFQ99732 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LITAFQ99732 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LITAFQ99732 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LITAFQ99732 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LITAFQ99732 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LITAFQ99732 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LITAFQ99732 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LITAFQ99732 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LITAFQ99732 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LITAFQ99732 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
LITAFQ99732 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LITAFQ99732 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LITAFQ99732 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LITAFQ99732 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
LITAFQ99732 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
LITAFQ99732 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LITAFQ99732 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LITAFQ99732 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LITAFQ99732 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LITAFQ99732 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LITAFQ99732 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LITAFQ99732 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LITAFQ99732 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LITAFQ99732 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LITAFQ99732 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LITAFQ99732 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LITAFQ99732 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LITAFQ99732 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LITAFQ99732 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LITAFQ99732 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LITAFQ99732 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LITAFQ99732 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LITAFQ99732 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LITAFQ99732 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LITAFQ99732 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LITAFQ99732 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LITAFQ99732 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LITAFQ99732 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LITAFQ99732 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LITAFQ99732 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LITAFQ99732 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LITAFQ99732 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LITAFQ99732 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LITAFQ99732 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LITAFQ99732 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LITAFQ99732 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LITAFQ99732 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LITAFQ99732 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LITAFQ99732 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LITAFQ99732 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LITAFQ99732 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LITAFQ99732 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
LITAFQ99732 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LITAFQ99732 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LITAFQ99732 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
LITAFQ99732 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LITAFQ99732 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LITAFQ99732 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LITAFQ99732 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LITAFQ99732 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LITAFQ99732 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LITAFQ99732 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LITAFQ99732 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LITAFQ99732 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LITAFQ99732 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LITAFQ99732 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LITAFQ99732 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LITAFQ99732 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LITAFQ99732 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LITAFQ99732 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LITAFQ99732 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LITAFQ99732 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LITAFQ99732 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LITAFQ99732 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LITAFQ99732 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LITAFQ99732 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LITAFQ99732 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LITAFQ99732 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LITAFQ99732 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LITAFQ99732 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LITAFQ99732 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LITAFQ99732 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LITAFQ99732 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LITAFQ99732 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LITAFQ99732 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LITAFQ99732 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LITAFQ99732 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LITAFQ99732 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LITAFQ99732 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LITAFQ99732 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LITAFQ99732 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LITAFQ99732 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LITAFQ99732 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LITAFQ99732 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LITAFQ99732 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LITAFQ99732 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms