Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms